Wenn Windows das Dateisystem nicht erkennt und die Platte formatieren will, dann hat es in der Regel die Dateizuordnungstabelle zerschossen.
Normalerweise laesst sich diese aus ihrer Sicherheitskopie restaurieren - allerdings funktioniert das nicht immer....
Unter XP diente dazu FixMBR immer recht gut und hat nicht nur die Partitionstabelle, sondern auch die Dateizuordnungstabelle der angesprochenen Partition reparieren koennen.
Ab Vista wird hierfuer Bootrec verwendet, welches dann mit entsprechenden Parametern auch auf eine per USB verbundene Platte angewendet werden kann - zumindest solange die Platte von Windows einen Laufwerksbuchstaben zugewiesen bekommen hat!
Code:
bootrec.exe <Laufwerksbuchstabe:> /fixmbr
<Laufwerksbuchstabe:> wird dann durch d:, e: oder wie auch immer die Platte bezeichnet ist ersetzt.